Третий сезон «Моей геройской академии» начинается с того, что ученики класса 1-А проходят финальные экзамены, но не обычные письменные тесты, а практические бои против собственных учителей. Каждому ученику предстоит сразиться с наставником в паре, и это испытание становится проверкой не только их сил, но и способности работать в команде. Особенно тяжело приходится Изуку Мидории, которому выпадает бой с самим Все Могучим. После успешной сдачи экзаменов начинаются летние сборы в лесу, где герои проходят интенсивную подготовку, чтобы получить временные лицензии. Однако идиллия рушится, когда на лагерь нападает Лига злодеев. В хаосе сражения похищают одного из учеников — Кацуки Бакуго, и герои вынуждены вступить в отчаянную погоню, чтобы спасти товарища. Параллельно раскрываются темные тайны прошлого Все Могучего, а его силы продолжают угасать, что ставит под угрозу само существование общества героев.
Во второй половине сезона напряжение достигает пика: герои проникают в логово злодеев, чтобы вернуть Бакуго, но сталкиваются с армией приспешников Лиги и их загадочным лидером — Все За Одного. Этот могущественный злодей оказывается старым врагом Все Могучего, и между ними вспыхивает решающая битва, которая становится центральным событием сезона. Все Могучий, понимая, что его время на исходе, использует остатки силы Всемогущества, чтобы защитить учеников и уничтожить врага, но платит за это страшную цену — он теряет свою силу навсегда. После этой схватки мир героев меняется: общество погружается в страх и недоверие, а ученики 1-А осознают, что теперь им придется взрослеть быстрее. Изуку, вдохновленный подвигом своего кумира, начинает глубже понимать природу своей силы и готовится к новым вызовам, ведь угроза со стороны злодеев никуда не исчезла, а лишь усилилась. Сезон заканчивается на мрачной ноте, оставляя героев перед лицом неопределенного будущего, где каждый из них должен найти свой путь к спасению мира.
