Второй сезон «Повелителя» начинается с того, что Айнз Оал Гоун окончательно утверждает свою власть в Назарике. После уничтожения армии королевства Ре-Эстиз и гибели «Солнца Кровавой Вали» — Газафа Строноффа, Великое Подземелье переходит к планомерной экспансии. Айнз, всё ещё сомневающийся в своей человечности, решает, что для безопасности его детей — стражей и слуг — необходимо создать государство. Он отправляет Альбедо и Демиурга на разведку в соседние земли, а сам берёт псевдоним Момон, чтобы лично изучить мир людей. Параллельно раскрывается судьба Энри Эммот и её деревни Карн: под защитой Назарика она превращается в процветающий форпост, а сама Энри получает титул «Матери-Земли». Однако идиллия рушится, когда в регион вторгается армия Священного Королевства — фанатики, поклоняющиеся богине-змее. Айнз использует их нападение как предлог для демонстрации силы, но сталкивается с неожиданным препятствием: в рядах врага оказывается загадочный чёрный рыцарь, чья магия не подчиняется стандартным законам этого мира.
Тем временем в Империи Бахут-Арвон зреет заговор. Император Жиркниф, впечатлённый мощью Айнза, тайно ищет союза с ним, но его придворные, подстрекаемые тайным обществом «Странствующих», готовят покушение. Кульминацией сезона становится битва за город Э-Рантель, где Айнз впервые применяет суперзаклинание «Падение небес», уничтожающее целую армию одним ударом. Однако истинная драма разворачивается в Назарике: Себас, верный страж, находит в городе избитую девушку-полукровку Туаре и, вопреки приказу Айнза, укрывает её. Это вызывает конфликт с Демиургом, который видит в поступке Себаса угрозу планам Повелителя. Айнз, разрываясь между ролью безжалостного владыки и остатками человечности Судзуки Сатору, вынужден устроить показательный суд над своим верным слугой. Финал сезона оставляет зрителя на грани: Назарик официально объявляет себя новым государством, а в небесах над континентом появляется тень дракона, намекая на то, что истинные хозяева этого мира — не люди и не нежить, а нечто гораздо более древнее и опасное.
