Риннэ Рокубо и Сакура Мамия продолжают свою нелёгкую работу по отправке неприкаянных душ в Колесо Перерождения. Второй сезон застаёт их в разгар очередного учебного года, но покой им только снится. Всё больше духов, застрявших между мирами из-за неразрешённых обид, проклятий или банальной жадности, требуют их внимания. Риннэ, как всегда, пытается свести концы с концами, экономя каждую иену на дешёвом чае и лапше быстрого приготовления, ведь его отец-мошенник то и дело втягивает сына в сомнительные авантюры. Сакура, обладающая даром видеть призраков, помогает ему не только морально, но и физически, часто оказываясь в центре мистических передряг. Их союз становится крепче, хотя Риннэ из-за своей гордости и бедности постоянно отказывается от её прямой помощи, предпочитая выпутываться самому.
В этом сезоне появляются новые могущественные противники и старые знакомые, чьи мотивы становятся глубже. Загадочная организация, собирающая души для тёмных ритуалов, начинает охоту на сильных духов, и Риннэ с Сакурой оказываются у них на пути. Рокудо, демон-кошка, всё так же верен своему хозяину, но его прошлое начинает всплывать наружу, намекая на трагическую связь с одним из главных злодеев. Даже дедушка Сабуро, вечно пытающийся занять у внука денег, неожиданно проявляет себя с серьёзной стороны, когда дело касается защиты семьи. Отношения между Риннэ и Сакурой развиваются медленно, но верно: он всё чаще позволяет себе быть уязвимым рядом с ней, а она учится принимать его упрямство и не лезть в дела, где он хочет справиться сам. Финал сезона подводит к серьёзному выбору: сможет ли Риннэ отказаться от своей мечты разорвать порочный круг перерождений, чтобы спасти тех, кто дорог ему здесь и сейчас.