Прошло десять лет после того, как человечество отразило вторжение с планеты Гол. Доктор Кабуто, гениальный создатель Мазингера Зет, исчез при загадочных обстоятельствах, оставив после себя лишь загадочную капсулу. Кодзи Кабуто, легендарный пилот, отошел от дел и стал ученым, посвятив себя исследованиям в области фотонной энергии. Он женился на Саяке Юми, и у них родился сын. Но идиллия рушится в один миг: из глубин космоса возвращается Лиза, дочь доктора Хелла, которая объявляет себя послом новой, невероятно могущественной цивилизации. Она приносит ультиматум: Земля должна сдаться, иначе будет уничтожена. В руках Лизы находится ключ к разгадке исчезновения доктора Кабуто — та самая капсула, которую он оставил. Кодзи вынужден снова сесть за штурвал, но старый Мазингер Зет уже не отвечает его требованиям. Вместе с командой ученых он начинает работу над новым, невиданным ранее оружием — Мазингером Инфинити, чья мощь способна превзойти все известные законы физики.
Война вспыхивает с новой силой, но на этот раз враг не просто армия монстров. Цивилизация, стоящая за Лизой, называет себя «Желающим» и обладает технологией, позволяющей манипулировать временем и пространством. В ходе сражений Кодзи сталкивается с призраками прошлого: воскресшими врагами, измененными версиями старых роботов и, что самое шокирующее, с самим доктором Хеллом, чье сознание было переписано и помещено в новое тело. Выясняется, что доктор Кабуто не просто исчез — он был похищен, чтобы завершить создание Мазингера Инфинити, который на самом деле является машиной, способной переписать реальность. Желающий стремится использовать этот механизм, чтобы стереть человечество и создать идеальный мир по своему образу. Кодзи предстоит не просто победить в битве роботов, а сделать невозможный выбор: пожертвовать всем, что он любит, чтобы спасти будущее, или позволить Инфинити изменить саму суть существования. Финальная схватка разворачивается на границе между измерениями, где старый друг становится врагом, а любовь и ненависть сплетаются в единый клубок, решая судьбу не только Земли, но и всей мультивселенной.
