Третий сезон застает команду в непривычно спокойной обстановке. Победа над прошлым врагом дала им передышку, и каждый из героев пытается найти себя в мирной жизни. Кёдзиро, наконец, решается на серьезный разговор с отцом о будущем семейного храма, Ибуки погружается в учебу, пытаясь наверстать упущенное, а Рё пытается совмещать тренировки с работой в кафе. Но идиллия рушится, когда в городе начинают происходить странные события: люди теряют память, а на месте преступлений остаются загадочные символы, напоминающие древние руны. Вскоре выясняется, что за этим стоит новая организация, которая называет себя «Архитекторы». В отличие от прошлых монстров, эти враги не нападают в лоб — они действуют хитростью, подрывая доверие между людьми и сея хаос в социальных сетях. Их цель — не уничтожить мир, а переписать саму реальность, стерев из нее все, что они считают «несовершенным».
Ситуация осложняется тем, что «Архитекторы» начинают охоту на самих защитников, используя их слабости и тайные желания. Кёдзиро сталкивается с призраком прошлого, который ставит под сомнение его веру в справедливость. Ибуки оказывается перед выбором между долгом и чувствами к человеку, который может оказаться врагом. А Рё, всегда бывший опорой команды, впервые теряет контроль над своей силой, что едва не приводит к трагедии. Чтобы выжить, героям приходится пересмотреть свои методы и научиться доверять друг другу в условиях, когда даже собственные воспоминания могут оказаться ложными. Финальная битва разворачивается не в реальном мире, а в цифровом пространстве, где каждый шаг может стереть грань между правдой и вымыслом. Защитникам предстоит понять, что настоящая сила кроется не в способности разрушать, а в умении сохранить человечность, когда весь мир вокруг пытается превратить их в бездушные инструменты.