Второй сезон застаёт Хироки и Юми уже не просто напарницами, а признанным дуэтом защитниц Токио. Кайдзю стали появляться чаще, и каждая новая битва оставляет на девушках свой след — не только физический, но и эмоциональный. Хироки начинает замечать, что её тело перестаёт подчиняться, а контроль над формой кайдзю даётся всё тяжелее, будто монстр внутри неё пытается вырваться наружу навсегда. Юми, в свою очередь, всё глубже погружается в изучение архивов корпорации, создавшей их оружие, и натыкается на данные о предыдущих поколениях девушек-кайдзю, которые бесследно исчезли после нескольких лет службы. Параллельно в городе объявляется загадочная третья девушка, способная превращаться в кайдзю, но её мотивы неясны — она не атакует людей, а охотится на другие порождения тьмы, словно пытаясь что-то найти или кого-то защитить.
Ситуация накаляется, когда выясняется, что волны кайдзю — не случайные катаклизмы, а целенаправленные попытки прорыва из параллельного измерения, где время течёт иначе. Хироки и Юми предстоит столкнуться с правдой: их силы имеют предел, и каждая трансформация сокращает срок человеческой жизни. Третья девушка оказывается выжившей из прошлого поколения, которая нашла способ замедлить деградацию, но ценой потери памяти. В финале сезона подруги должны сделать невозможный выбор — либо пожертвовать собой, чтобы закрыть разрыв между мирами раз и навсегда, либо найти третий путь, который потребует объединить силы всех трёх кайдзю в едином ударе, рискуя потерять контроль и навсегда остаться монстрами. Последние кадры показывают, как над городом встаёт огромная тень, а Хироки сжимает руку Юми, шепча: «Мы справимся, даже если придётся забыть, кто мы».