Пятый сезон «Песни боевых принцесс: Мехасимфония» начинается с тишины. После грандиозной битвы, едва не расколовшей континент, мир погрузился в хрупкое перемирие. Главные героини, пилоты легендарных Меха-симфонических доспехов, разбросаны по разным уголкам планеты. Айрис, чей голос когда-то заставлял броню петь, теперь молчит, пытаясь заглушить внутреннюю пустоту синтетическими наркотиками. Лейтенант Юки, лишившаяся правой руки в прошлом сезоне, тренирует новобранцев, но её протез, созданный из осколков вражеского меха, начинает жить собственной жизнью, шепча ей забытые тактические схемы. Тем временем в подземных лабораториях пробуждается древний артефакт — «Нота Безмолвия», способный стереть из реальности саму концепцию музыки. Старые враги, Корпорация Гармония, предлагают принцессам сделку: их боевые способности в обмен на технологию, которая вернёт погибших товарищей. Но цена оказывается слишком высокой — каждый такт их песни начинает стирать воспоминания о тех, кого они любят.
Второй акт сезона превращает войну в трагический концерт. Когда первая из принцесс, пилотесса-ветеран Рейка, жертвует своим голосом, чтобы спасти город, её меха-доспех застывает в форме гигантского камертона, издающего похоронный звон. Оставшиеся героини понимают, что «Нота Безмолвия» — это не оружие, а живой организм, питающийся их эмоциями. Юки, чей протез полностью сросся с нервной системой, обнаруживает, что может слышать мысли мёртвых мехов, которые просят её не дать им воскреснуть. Айрис, наконец, срывает голосовые связки в финальной битве, но её беззвучная песня, переданная через вибрации земли, объединяет всех пилотов в единый хор. Кульминация разворачивается в небе над руинами старой столицы: пять искалеченных мехов, управляемых девушками, потерявшими всё, кроме воли, исполняют «Реквием по утраченной гармонии». Их доспехи рассыпаются в пыль, но из этой пыли рождается новая мелодия — тихая, без слов, которая заставляет даже вражеские машины сложить оружие. Финал остаётся открытым: мир спасён, но принцессы исчезают, оставляя после себя лишь эхо в радиоволнах и вопрос — была ли эта война их песней или песня была войной?