Лелуш Ламперуж, он же Зеро, мертв. Его план, растянувшийся на годы и унесший миллионы жизней, завершился. Он принял ненависть мира, позволил своему лучшему другу Сузаку пронзить себя мечом, чтобы навсегда похоронить личность императора-тирана и создать миф о герое-мученике. Но смерть не стала для него концом. Вместо пустоты он ощущает странное, тягучее тепло. Его сознание, вопреки законам физики и логики, не угасло. Он просыпается в теле, которое не помнит, в мире, который не узнает. Прошло несколько лет. Империя Священная Британния пала, но на её обломках возникла новая сила — Объединённая Федерация Наций, хрупкий союз, балансирующий на грани хаоса. А где-то в тени, в древних храмах и секретных лабораториях, пробуждается нечто, что древнее самого Код Гиаса. Древние артефакты, оставленные цивилизацией, что предшествовала человечеству, начинают излучать энергию, искажающую реальность. Лелуш, лишённый своего Гиаса, но всё ещё обладающий острым умом и даром стратега, оказывается в центре нового заговора. Он видит, как тени прошлого — те, кто знал его истинное лицо, и те, кто лишь слышал легенды — начинают действовать. Новая угроза не терпит компромиссов. Она не хочет завоевывать мир — она хочет его переписать, стереть саму память о человеческих страданиях, а вместе с ней и свободу воли.
Сузаку, теперь носящий маску Зеро и пытающийся искупить свои грехи служением миру, первым сталкивается с аномалией. Он чувствует, что за кулисами политических интриг стоит чья-то нечеловеческая воля. Нанналли, ослепшая и прикованная к инвалидному креслу, но ставшая символом новой эпохи, ощущает странную вибрацию в своей крови — эхо Кода, который когда-то принадлежал её брату. Когда древний механизм, спрятанный под руинами старого Токио, начинает вращаться, реальность трещит по швам. Лелуш, скрывающийся под личиной обычного студента, вынужден снова взять на себя роль шахматиста. Но теперь его противник не просто император или террорист. Это сама структура бытия, которая решила, что человечество слишком опасно для самого себя. Ему придется объединиться с теми, кого он предал, и обмануть тех, кто ему доверяет. Вопрос стоит ребром: можно ли построить лучшее будущее, если для этого нужно стереть прошлое? Или же цена абсолютного покоя — это полное уничтожение личности? Лелуш, воскресший вопреки всему, должен найти ответ, прежде чем мир погрузится в вечный, безмолвный сон, где не будет ни боли, ни радости, ни выбора.
