Мир, где человечество проиграло войну с порождениями собственного подсознания. После того как таинственная организация «Орган геноцида» стерла с лица земли все крупные города, выжившие ютятся в руинах, а само понятие «реальность» стало зыбким. Главный герой, солдат по имени Кай, теряет в бою не только товарищей, но и собственную память. Очнувшись в подземном бункере, он узнает, что его тело было модифицировано, а в груди бьется сердце, способное улавливать «смертельные волны» — излучение, которое испускают монстры перед атакой. Кай становится идеальным оружием, но цена этого дара — постоянная боль и видения чужих смертей. Единственная зацепка, которая у него остается — это имя девушки по имени Аой, чей образ мерцает в обрывках воспоминаний. Он отправляется на поверхность, где радиоактивный пепел смешивается с кристаллизовавшейся человеческой скорбью, чтобы найти ее и понять, почему именно он был выбран в качестве носителя этого проклятого органа.
Путь Кая превращается в кровавую одиссею через постапокалиптическую Японию, где каждый выживший либо сошел с ума, либо превратился в хищника. Он сталкивается с сектой, поклоняющейся «Органу» как божеству, и с отрядами людей, которые охотятся на таких, как он, чтобы извлечь имплант. Постепенно Кай осознает страшную правду: «Орган геноцида» — это не внешняя угроза, а коллективное бессознательное желание человечества к самоуничтожению, материализовавшееся в виде биологического оружия. Аой, которую он ищет, оказывается не просто девушкой из прошлого, а ключом к управлению этим механизмом — она способна транслировать волю к жизни, подавляя импульсы смерти. Но когда Кай находит ее, выясняется, что она уже не человек, а аватар самой системы, запертый в бесконечной петле страданий. Финальная битва разворачивается не снаружи, а внутри сознания героя: чтобы остановить геноцид, ему придется разорвать собственное сердце, буквально вырвав из груди источник силы, и принять правду о том, что спасение мира возможно только через отказ от самой идеи насилия, даже если это означает исчезновение человечества как вида.
